197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0154 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0154  site-specific DNA-methyltransferase, type I modification  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  85.59 
 
 		 567 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  89.64 
 
 		 567 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  49.11 
 
 		 544 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  50.42 
 
 		 569 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  51.5 
 
 		 568 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  48.71 
 
 		 849 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  51.29 
 
 		 570 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  45.12 
 
 		 528 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  46.05 
 
 		 540 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  45.87 
 
 		 523 aa  190  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  45.87 
 
 		 519 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  44.04 
 
 		 535 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  44.5 
 
 		 517 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  41.94 
 
 		 576 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  40.65 
 
 		 532 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  42.15 
 
 		 525 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  42.15 
 
 		 525 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  41.9 
 
 		 511 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  41.47 
 
 		 544 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  41.46 
 
 		 538 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  42.65 
 
 		 515 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  39.19 
 
 		 527 aa  155  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  41.23 
 
 		 519 aa  154  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  41.71 
 
 		 514 aa  154  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  41.23 
 
 		 518 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  40.78 
 
 		 498 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  40.28 
 
 		 527 aa  152  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  39.64 
 
 		 540 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  40.78 
 
 		 497 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  38.79 
 
 		 520 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  41.43 
 
 		 543 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  40.76 
 
 		 517 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  40.67 
 
 		 501 aa  148  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  40.95 
 
 		 541 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  36.02 
 
 		 510 aa  148  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  40.67 
 
 		 501 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  41.3 
 
 		 540 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  38.18 
 
 		 549 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  41.12 
 
 		 518 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  40.48 
 
 		 500 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  40.27 
 
 		 521 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  39.17 
 
 		 544 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  38.89 
 
 		 548 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  33.61 
 
 		 564 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  38.89 
 
 		 540 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.92 
 
 		 503 aa  135  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0065  N4/N6-methyltransferase family protein  35.68 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  37.62 
 
 		 537 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  33.96 
 
 		 539 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  35.14 
 
 		 529 aa  119  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  34.23 
 
 		 529 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  34.29 
 
 		 538 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.18 
 
 		 533 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  32.41 
 
 		 574 aa  98.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  30.19 
 
 		 528 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  30.45 
 
 		 822 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  32.87 
 
 		 574 aa  95.1  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  31.02 
 
 		 508 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  31.02 
 
 		 587 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  29.61 
 
 		 808 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  30.49 
 
 		 814 aa  93.2  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  31.94 
 
 		 574 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  26.39 
 
 		 510 aa  92.8  5e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  30.43 
 
 		 495 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  30.43 
 
 		 495 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  30.37 
 
 		 662 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  29.95 
 
 		 495 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  33.48 
 
 		 891 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  30.62 
 
 		 816 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  30.23 
 
 		 508 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  30.23 
 
 		 523 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2469  N-6 DNA methylase  30.37 
 
 		 772 aa  85.9  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.28 
 
 		 860 aa  85.5  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  31.39 
 
 		 908 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  31.13 
 
 		 513 aa  85.1  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  28.97 
 
 		 815 aa  82.8  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  28.44 
 
 		 694 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  31.92 
 
 		 511 aa  82.8  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  32.27 
 
 		 529 aa  82.4  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.02 
 
 		 517 aa  82  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  29.55 
 
 		 498 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  30.04 
 
 		 516 aa  82  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  29.49 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.95 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  29.26 
 
 		 856 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  31.31 
 
 		 505 aa  79  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  25.23 
 
 		 522 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  27.1 
 
 		 633 aa  78.2  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  28.45 
 
 		 853 aa  77  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  29.63 
 
 		 824 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  27.52 
 
 		 526 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  23.85 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  26.05 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.35 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  28.28 
 
 		 585 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  28.04 
 
 		 568 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  26.73 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  28.46 
 
 		 518 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  28.91 
 
 		 863 aa  72  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>