36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1032 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1032  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
1283 aa  75.9  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  37.11 
 
 
1500 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  43.06 
 
 
845 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  38.89 
 
 
849 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  41.67 
 
 
843 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  46.3 
 
 
785 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  46.3 
 
 
911 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  34.65 
 
 
934 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  40 
 
 
1068 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  34.07 
 
 
1324 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  36.99 
 
 
1314 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  37.84 
 
 
1039 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  33.33 
 
 
1261 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  33 
 
 
675 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  34.57 
 
 
829 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  40.62 
 
 
373 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  35.9 
 
 
1010 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  41.38 
 
 
1478 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  40.62 
 
 
801 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  34.12 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
1424 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  34.12 
 
 
1228 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  34.62 
 
 
1311 aa  45.8  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  30.86 
 
 
1523 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  33.33 
 
 
838 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  38.6 
 
 
1131 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  38.89 
 
 
992 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  38.46 
 
 
900 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  37.5 
 
 
859 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  32.58 
 
 
793 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10398  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
335 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 
1125 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  36.11 
 
 
1000 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
1288 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3848  NB-ARC domain-containing protein  34.38 
 
 
811 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>