48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1943 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  100 
 
 		 267 aa  547  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  62.18 
 
 		 293 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  57.46 
 
 		 365 aa  315  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  51.87 
 
 		 292 aa  275  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  52.24 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  38.3 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  33.58 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  24.88 
 
 		 680 aa  52.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 311 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 313 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 321 aa  52.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 313 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 320 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  26.28 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  27.74 
 
 		 310 aa  49.3  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.2 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  30.37 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  28.66 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.28 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1039  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.64 
 
 		 373 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  27.22 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  26.43 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.15 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4200  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341727  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>