More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1288 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  283  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  78.83 
 
 		 137 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  72.99 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  47.45 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  44.12 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  46.97 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0826  response regulator receiver domain-containing protein  61.7 
 
 		 94 aa  123  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  45.8 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  41.79 
 
 		 146 aa  115  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  41.86 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  40.43 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  40.58 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  39.23 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  44.53 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  41.54 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 160 aa  106  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  36.43 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  38.3 
 
 		 151 aa  104  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 152 aa  103  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  40.46 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  41.22 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  36.03 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  38.19 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  39.26 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  40.74 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  37.68 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  38.64 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3162  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  41.48 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  40.31 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  40 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  44.27 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  34.06 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  41.41 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  41.48 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  40.62 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  40.62 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  40.62 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  40.62 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  40.62 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  40.62 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  40.62 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  40.62 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 167 aa  95.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  40 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  39.39 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 156 aa  94  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  38.17 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  38.93 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  37.12 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>