More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1268 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1268  translation elongation factor P  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0977  translation elongation factor P  57.3 
 
 
186 aa  222  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.025181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0851  translation elongation factor P  57.3 
 
 
186 aa  222  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0158  elongation factor P  45.7 
 
 
190 aa  174  7e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1042  translation elongation factor P  43.62 
 
 
190 aa  167  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000205263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1500  elongation factor P  47.8 
 
 
188 aa  167  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2102  elongation factor P  45.95 
 
 
187 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0533599  hitchhiker  0.00367804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1706  elongation factor P  46.15 
 
 
188 aa  164  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0608317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3184  elongation factor P  43.78 
 
 
187 aa  164  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.509533  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1206  elongation factor P  42.78 
 
 
211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1710  elongation factor P  43.78 
 
 
186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820092  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3254  elongation factor P  43.32 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310404  normal  0.360922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1884  elongation factor P  42.16 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1652  elongation factor P  43.78 
 
 
186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.397183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2531  elongation factor P  41.18 
 
 
189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  42.39 
 
 
186 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1987  elongation factor P  43.85 
 
 
187 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1314  elongation factor P  42.16 
 
 
187 aa  159  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785399  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0379  elongation factor P  41.62 
 
 
188 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.399775 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1958  elongation factor P  43.72 
 
 
187 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2738  elongation factor P  42.16 
 
 
188 aa  158  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.827612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2404  elongation factor P  43.78 
 
 
188 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2980  elongation factor P  42.7 
 
 
187 aa  157  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2094  elongation factor P  41.71 
 
 
213 aa  157  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3478  elongation factor P  41.71 
 
 
189 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619484  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2589  translation elongation factor P (EF-P)  44.62 
 
 
188 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.626789  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3194  elongation factor P  41.62 
 
 
188 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0761  elongation factor P  41.62 
 
 
188 aa  154  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0455  elongation factor P  41.94 
 
 
189 aa  154  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0479  elongation factor P  42.7 
 
 
188 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0196  translation elongation factor P  41.94 
 
 
191 aa  154  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101901  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2131  elongation factor P  42.7 
 
 
188 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2021  elongation factor P  42.02 
 
 
187 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1643  elongation factor P  40.54 
 
 
188 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1581  elongation factor P  42.22 
 
 
185 aa  153  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000212505  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3710  elongation factor P  40.64 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0822316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2743  elongation factor P  40.64 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.481823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3225  elongation factor P  41.94 
 
 
189 aa  151  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2504  elongation factor P  38.92 
 
 
188 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1891  elongation factor P  41.49 
 
 
187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.405804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0248  elongation factor P  41.49 
 
 
187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72476  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2302  elongation factor P  41.08 
 
 
188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0910613  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  39.67 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  40 
 
 
188 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1077  elongation factor P  41.62 
 
 
187 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3230  elongation factor P  40 
 
 
188 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3217  elongation factor P  40.64 
 
 
188 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  42.39 
 
 
185 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2809  elongation factor P  38.38 
 
 
216 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1240  translation elongation factor P (EF-P)  41.21 
 
 
187 aa  149  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1618  translation elongation factor P (EF-P)  39.44 
 
 
186 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000274122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4012  elongation factor P  40 
 
 
188 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2792  elongation factor P  38.38 
 
 
188 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  42.37 
 
 
186 aa  148  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  38.04 
 
 
185 aa  147  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2956  elongation factor P  38.38 
 
 
188 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3005  elongation factor P  39.13 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  40.56 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  41.44 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  39.67 
 
 
185 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  39.44 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  38.59 
 
 
185 aa  144  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  38.89 
 
 
185 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  38.89 
 
 
185 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1673  elongation factor P  37.16 
 
 
190 aa  143  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0528858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  38.89 
 
 
185 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  38.89 
 
 
185 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  38.89 
 
 
185 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  38.89 
 
 
185 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  38.89 
 
 
185 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  38.89 
 
 
185 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0468  elongation factor P  36.41 
 
 
185 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0449395  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  42.11 
 
 
187 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  37.78 
 
 
188 aa  142  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  38.12 
 
 
187 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  38.33 
 
 
185 aa  141  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  38.33 
 
 
187 aa  141  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6026  elongation factor P  37.97 
 
 
189 aa  141  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524609  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1695  elongation factor P  37.7 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3799  elongation factor P  37.97 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282842  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  38.92 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  37.84 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  38.89 
 
 
185 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  39.44 
 
 
185 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4128  elongation factor P  37.97 
 
 
189 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593775  normal  0.232702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  38.04 
 
 
185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  37.7 
 
 
199 aa  137  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  36.22 
 
 
185 aa  137  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  36.22 
 
 
185 aa  137  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  38.89 
 
 
185 aa  137  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  37.78 
 
 
185 aa  137  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  36.9 
 
 
189 aa  137  8.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0011  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000591354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>