24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0450 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0450  tRNA intron endonuclease  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000001619 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.76 
 
 		 174 aa  96.3  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.54 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.93 
 
 		 176 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.93 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.49 
 
 		 177 aa  92  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  32.19 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  32.87 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  32.28 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  31.25 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  28 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  28.57 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  34.97 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  27.1 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  25.75 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0311  tRNA intron endonuclease domain-containing protein  24.71 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  29.76 
 
 		 289 aa  48.5  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  31.18 
 
 		 348 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  28.38 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  23.08 
 
 		 351 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  35.14 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  22.58 
 
 		 375 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  29.67 
 
 		 182 aa  42  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  25 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>