60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4379 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  98.97 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  89.81 
 
 		 206 aa  383  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  55.83 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  55 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  52.24 
 
 		 205 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  52.74 
 
 		 205 aa  207  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  58.64 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  50.49 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  43.2 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  51.01 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  47.03 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  46.57 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  45.81 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  50.51 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  46.46 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  45.69 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  45.69 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  46 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  39.13 
 
 		 210 aa  154  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.6 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.6 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.6 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  29.6 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.6 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.6 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.6 
 
 		 252 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.97 
 
 		 258 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  28.95 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 260 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.6 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.8 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.08 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.08 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.54 
 
 		 257 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  24.03 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.39 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  35.63 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.01 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.57 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  35.71 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 337 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.13 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.57 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.77 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.1 
 
 		 293 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  33.03 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.78 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.28 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.28 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  27.46 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.28 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 190 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 258 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>