57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3961 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3961  membrane protein-like  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.201378  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  32.26 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  37.27 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  36.7 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  38.18 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  34.17 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  35.96 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  41.18 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  33.71 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  31.3 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  27.72 
 
 		 301 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  42.86 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  29.85 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  37.8 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  30.43 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  26.73 
 
 		 286 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  28.32 
 
 		 233 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  32.86 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  40.79 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  40.3 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  38.36 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  38.36 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  30.39 
 
 		 248 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  38.36 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  34.34 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1863  protein of unknown function DUF1003  37.66 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.600017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  32.41 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0716  hypothetical protein  32.93 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  32.84 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1917  hypothetical protein  38.71 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  32.32 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  32.04 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  37.14 
 
 		 348 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  33.85 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  30.1 
 
 		 246 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  37.14 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  28.26 
 
 		 276 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  29.35 
 
 		 166 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  30.77 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  26.87 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  32.39 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  34.29 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  34.62 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  33.6 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  35.71 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  32.1 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  34.15 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  34.94 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  31.03 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  30.65 
 
 		 156 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  29.29 
 
 		 232 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>