More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3642 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  41.97 
 
 		 958 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  42.04 
 
 		 946 aa  641    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  41.47 
 
 		 953 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3982  preprotein translocase SECA subunit  41.99 
 
 		 899 aa  636    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7588  preprotein translocase subunit SecA  42.09 
 
 		 950 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.334261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0530  preprotein translocase subunit SecA  42.61 
 
 		 946 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0299  preprotein translocase subunit SecA  42.09 
 
 		 946 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3642  SecA DEAD-like  100 
 
 		 803 aa  1611    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  42.42 
 
 		 949 aa  641    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  41.92 
 
 		 910 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  43.01 
 
 		 958 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  43.08 
 
 		 956 aa  632  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  41.47 
 
 		 951 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  42.56 
 
 		 935 aa  630  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2518  preprotein translocase subunit SecA  41.68 
 
 		 903 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  42.11 
 
 		 947 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  41.04 
 
 		 963 aa  623  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0512  preprotein translocase, SecA subunit  40.87 
 
 		 931 aa  623  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  40.81 
 
 		 970 aa  621  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1021  preprotein translocase subunit SecA  41.32 
 
 		 906 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  40.81 
 
 		 970 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  41.56 
 
 		 905 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2761  preprotein translocase subunit SecA  42.25 
 
 		 906 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3831  preprotein translocase subunit SecA  41.32 
 
 		 905 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  40.69 
 
 		 970 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0361  preprotein translocase subunit SecA  40.36 
 
 		 910 aa  617  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.746169  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2917  preprotein translocase subunit SecA  41.03 
 
 		 895 aa  612  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  41.2 
 
 		 906 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  41.2 
 
 		 906 aa  610  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2831  preprotein translocase subunit SecA  41.77 
 
 		 908 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.125346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  41.74 
 
 		 903 aa  611  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  41.65 
 
 		 908 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  42.09 
 
 		 909 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0922  preprotein translocase subunit SecA  40.54 
 
 		 921 aa  600  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.666696  normal  0.803255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  39.91 
 
 		 955 aa  598  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  42.05 
 
 		 896 aa  595  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0289  preprotein translocase subunit SecA  41.06 
 
 		 903 aa  594  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.703701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  41.26 
 
 		 912 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2246  preprotein translocase subunit SecA  41.59 
 
 		 939 aa  591  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  40.36 
 
 		 903 aa  588  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  40.4 
 
 		 899 aa  589  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2599  preprotein translocase subunit SecA  41.18 
 
 		 901 aa  588  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.213228  normal  0.874755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3567  preprotein translocase subunit SecA  41.1 
 
 		 908 aa  586  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  41.37 
 
 		 932 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  41.03 
 
 		 911 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2027  preprotein translocase, SecA subunit  40.05 
 
 		 933 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.942365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  40.31 
 
 		 896 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  40.31 
 
 		 896 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  40.5 
 
 		 904 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1220  preprotein translocase subunit SecA  42.87 
 
 		 916 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  41.56 
 
 		 932 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  41.21 
 
 		 912 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  40.86 
 
 		 910 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  42.88 
 
 		 842 aa  582  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 936 aa  582  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  40.49 
 
 		 934 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  41.68 
 
 		 932 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  40.02 
 
 		 917 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  40.26 
 
 		 934 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  41.68 
 
 		 932 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  41.68 
 
 		 932 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  40.24 
 
 		 909 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  40.47 
 
 		 909 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  37.95 
 
 		 862 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  40.5 
 
 		 917 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  40.9 
 
 		 930 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  39.57 
 
 		 911 aa  577  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  41.06 
 
 		 916 aa  576  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  41.2 
 
 		 931 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  38.97 
 
 		 954 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  40.58 
 
 		 848 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  41.2 
 
 		 931 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  41.06 
 
 		 913 aa  576  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  38.86 
 
 		 901 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 931 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  39.53 
 
 		 907 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 931 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  39.65 
 
 		 924 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  40.54 
 
 		 936 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 931 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  39.43 
 
 		 896 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 931 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  40.73 
 
 		 908 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 936 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  40.74 
 
 		 919 aa  574  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  39.12 
 
 		 899 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  40.26 
 
 		 908 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  39.9 
 
 		 917 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 931 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 931 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2687  preprotein translocase subunit SecA  41.44 
 
 		 912 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.783539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  40.26 
 
 		 908 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  41.61 
 
 		 918 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  39.44 
 
 		 896 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  40.66 
 
 		 931 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  40.14 
 
 		 908 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  39.07 
 
 		 915 aa  572  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  38.09 
 
 		 862 aa  570  1e-161  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  39.69 
 
 		 917 aa  569  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  39.29 
 
 		 906 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>