112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2127 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  75.71 
 
 		 620 aa  969    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  78.7 
 
 		 601 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  76.25 
 
 		 618 aa  951    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  100 
 
 		 603 aa  1252    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  76.79 
 
 		 669 aa  988    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  35.58 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  34.69 
 
 		 619 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  40.94 
 
 		 579 aa  357  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  35.83 
 
 		 572 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  37.44 
 
 		 563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  34.76 
 
 		 617 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  37.16 
 
 		 591 aa  330  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  35.98 
 
 		 585 aa  330  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  35.93 
 
 		 572 aa  329  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  37.48 
 
 		 618 aa  327  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  36.54 
 
 		 609 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  36.54 
 
 		 609 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  34.22 
 
 		 584 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  35.92 
 
 		 573 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  37.2 
 
 		 581 aa  323  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  35.6 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  37.36 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  37.36 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  35.6 
 
 		 573 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  35.39 
 
 		 599 aa  321  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  34.21 
 
 		 567 aa  320  5e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  37.08 
 
 		 581 aa  319  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  37.06 
 
 		 581 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  37.03 
 
 		 620 aa  317  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  34.37 
 
 		 619 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  37.06 
 
 		 581 aa  316  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  35.36 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2660  Carbamoyltransferase  34.33 
 
 		 597 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  34.21 
 
 		 612 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  37.67 
 
 		 657 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  35.53 
 
 		 584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  35.53 
 
 		 584 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  35.37 
 
 		 584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  35.37 
 
 		 584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  35.37 
 
 		 584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  35.37 
 
 		 584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  35.37 
 
 		 584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  36.54 
 
 		 678 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  39.03 
 
 		 651 aa  306  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  35.92 
 
 		 610 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  35.96 
 
 		 613 aa  300  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1703  carbamoyltransferase  32.14 
 
 		 650 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  35.11 
 
 		 620 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  34.63 
 
 		 621 aa  296  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0555  Carbamoyltransferase  35.16 
 
 		 613 aa  294  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  33.44 
 
 		 584 aa  293  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  38.62 
 
 		 605 aa  293  7e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  36.1 
 
 		 606 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  33.39 
 
 		 588 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  32.46 
 
 		 551 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  35.51 
 
 		 547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  35.8 
 
 		 545 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  35.71 
 
 		 623 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  34.6 
 
 		 551 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  33.94 
 
 		 595 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  33.06 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  34.61 
 
 		 550 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  32.67 
 
 		 548 aa  270  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  34.23 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  34 
 
 		 622 aa  264  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  34.7 
 
 		 546 aa  263  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  32.62 
 
 		 633 aa  257  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  33.28 
 
 		 670 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  31.26 
 
 		 690 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  30.74 
 
 		 585 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  31.4 
 
 		 585 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  30.86 
 
 		 585 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  35.07 
 
 		 587 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1438  Carbamoyltransferase  33.5 
 
 		 574 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3283  Carbamoyltransferase  34.62 
 
 		 669 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503315  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  33.26 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  35.5 
 
 		 589 aa  238  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  30.11 
 
 		 584 aa  238  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  35.51 
 
 		 589 aa  237  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0758  carbamoyltransferase  29.74 
 
 		 572 aa  236  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0642961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  30.91 
 
 		 584 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  29.66 
 
 		 585 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43222  predicted protein  40.06 
 
 		 919 aa  231  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  29.92 
 
 		 585 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  29.82 
 
 		 585 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  30.26 
 
 		 585 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  29.82 
 
 		 585 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  35.57 
 
 		 589 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  29.6 
 
 		 585 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  34.32 
 
 		 591 aa  226  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  29.77 
 
 		 585 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  33.61 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  33.06 
 
 		 594 aa  220  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37745  carbamoyl transferase  31 
 
 		 574 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0813971  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3355  carbamoyltransferase  29.25 
 
 		 656 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.731341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  29.71 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3227  carbamoyl transferase  29.68 
 
 		 574 aa  190  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  26.89 
 
 		 600 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  27.2 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1281  Carbamoyltransferase  28.5 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000234194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>