119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0157 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0157  ribosomal RNA adenine methylase transferase  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0199  ribosomal RNA adenine methylase transferase  94.97 
 
 		 200 aa  384  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0193  phospholipid N-methyltransferase  85.43 
 
 		 200 aa  357  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0331  ribosomal RNA adenine methylase transferase  83 
 
 		 200 aa  349  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0431  ribosomal RNA adenine methylase transferase  81.5 
 
 		 200 aa  343  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0389  putative phospholipid N-methyltransferase  81.5 
 
 		 200 aa  341  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0338  ribosomal RNA adenine methylase transferase  80 
 
 		 201 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0870477  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6929  phospholipid N-methyltransferase  56.85 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6272  phospholipid N-methyltransferase  57.81 
 
 		 206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552401  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2962  phospholipid N-methyltransferase  57.65 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.422208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3188  phospholipid N-methyltransferase  59.14 
 
 		 218 aa  226  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.105598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3144  phospholipid N-methyltransferase  58.6 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3921  phospholipid N-methyltransferase  59.68 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.785681  normal  0.164521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0130  ribosomal RNA adenine methylase transferase  55.61 
 
 		 264 aa  211  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0355  phospholipid N-methyltransferase  55.43 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191687  normal  0.556592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2957  Methyltransferase type 12  53.33 
 
 		 284 aa  203  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0788  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.41 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4590  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase or phosphatidyl-N-methylethanolaminen-methyltransferase  38.17 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486089  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2043  phospholipid N-methyltransferase  35.87 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114973  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0681  ribosomal RNA adenine methylase transferase  39.46 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4327  phospholipid N-methyltransferase protein  36.56 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2127  phospholipid N-methyltransferase  34.78 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3542  hypothetical protein  32.97 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0349  methyltransferase  34.67 
 
 		 197 aa  131  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3006  hypothetical protein  42.27 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0961  hypothetical protein  42.27 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2896  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.93 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2958  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.93 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1627  hypothetical protein  42.93 
 
 		 228 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0444  hypothetical protein  42.93 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2589  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.93 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0186  phospholipid N-methyltransferase PmtA  42.93 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5159  methyltransferase type 11  43.65 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3314  methyltransferase type 11  43.09 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0802938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3372  phospholipid N-methyltransferase-like protein  37.97 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4878  ribosomal RNA adenine methylase transferase  40.84 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00569691  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2854  phospholipid N-methyltransferase-like  41.9 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0112  Methyltransferase type 12  37.7 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4790  methyltransferase type 12  41.34 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310802  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3377  methyltransferase type 12  41.34 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4139  methyltransferase type 12  41.34 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0102  Methyltransferase type 12  37.7 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4721  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.73 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4577  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  29.73 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5083  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  29.73 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926565  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1193  methyltransferase type 12  37.77 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4968  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.65 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4561  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  28.11 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000778577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4983  ribosomal RNA adenine dimethylase domain-containing protein  28.65 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4954  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.65 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0572  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  36.26 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.667801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4944  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.65 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0915  methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0281  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  28.11 
 
 		 192 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2392  methyltransferase type 12  36.56 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0746  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0943424  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0594  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  36.46 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3906  putative phospholipid N-methyltransferase  37.24 
 
 		 169 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5256  ribosomal RNA adenine dimethylase domain protein  26.88 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4803  adenosine dimethyl transferase  26.88 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000013839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4668  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.57 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1211  phospholipid N-methyltransferase  33.5 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0146492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19850  phospholipid N-methyltransferase  32.8 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  decreased coverage  0.0000402222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3996  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  32.98 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518613  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1585  phospholipid N-methyltransferase-like protein  27.42 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0911631  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2771  phospholipid N-methyltransferase  29.83 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2818  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.973514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2651  Ribosomal RNA adenine methylase transferase- like protein  32.43 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1365  phospholipid N-methyltransferase  28.89 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.759046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0962  hypothetical protein  25.54 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2253  Methyltransferase type 12  31.18 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3775  hypothetical protein  34.39 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3870  hypothetical protein  23.66 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0359454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3985  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349003  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3529  methyltransferase type 12  25.95 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354296  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2857  hypothetical protein  33.7 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2781  phospholipid N-methyltransferase-like protein  31.71 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0502  ribosomal RNA adenine dimethylase; phospholipid N-methyltransferase  26.88 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1604  methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614347  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  38 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1053  ribosomal RNA adenine methylase transferase  31.68 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000092435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7010  hypothetical protein  28.49 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  hitchhiker  0.000974477 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  30 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  26.79 
 
 		 269 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  35.4 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5377  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  28.33 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0154  phospholipid N-methyltransferase  26.83 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0096  generic methyltransferase  25.17 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  29.6 
 
 		 271 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  41.67 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3913  dimethyladenosine transferase  30.61 
 
 		 269 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  29.69 
 
 		 276 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1187  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 274 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09271  dimethyladenosine transferase  29.03 
 
 		 274 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0103  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 258 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0866  dimethyladenosine transferase  26.92 
 
 		 276 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2079  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 258 aa  45.4  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  38.89 
 
 		 297 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>