43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5327 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 211 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  45.23 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  40.91 
 
 		 270 aa  101  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  46.86 
 
 		 263 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  41.95 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4837  type II secretion system protein  40.17 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  38.75 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  36.11 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  34.15 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  38.26 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  32.32 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  33.73 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  43.33 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  41.67 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  34.55 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  32.02 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  45.45 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  26.99 
 
 		 325 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 327 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  39.25 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  29.01 
 
 		 320 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  31.92 
 
 		 271 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25290  Flp pilus assembly protein TadB  33.73 
 
 		 264 aa  48.1  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 310 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  29.34 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  35.65 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0121  hypothetical protein  32.5 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 333 aa  45.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 328 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  25.24 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1296  Flp pilus assembly protein  37.8 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  29.59 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  22.76 
 
 		 335 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 660 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 310 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 326 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  35 
 
 		 242 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  25.66 
 
 		 282 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  23.45 
 
 		 334 aa  41.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>