More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2103 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  100 
 
 		 353 aa  713    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  69.23 
 
 		 354 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  66.76 
 
 		 366 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  67.32 
 
 		 363 aa  434  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  58.06 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  61.54 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  50.33 
 
 		 332 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  48.12 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  48.12 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  48.12 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  48.12 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  48.12 
 
 		 332 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  47.81 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  47.81 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  53.14 
 
 		 344 aa  328  9e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  48.48 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  53.11 
 
 		 332 aa  326  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  47.5 
 
 		 332 aa  325  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  46.23 
 
 		 321 aa  325  7e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  47.95 
 
 		 332 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  47.63 
 
 		 332 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  49.68 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  46.48 
 
 		 331 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  44.34 
 
 		 335 aa  315  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  44.34 
 
 		 335 aa  315  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  42.9 
 
 		 321 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  40.13 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  40 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  43.61 
 
 		 364 aa  246  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  39.56 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  34.81 
 
 		 331 aa  215  9.999999999999999e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  39.25 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  42.21 
 
 		 326 aa  206  7e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  42.24 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  42.24 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  40.14 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  41.58 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  40.48 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  35.44 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  40.07 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  35.93 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  41.73 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  41.61 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  36.64 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  36.64 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  36.36 
 
 		 350 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  36.34 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  36.48 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  36.36 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  39.12 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  39.57 
 
 		 346 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  34.88 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  40.07 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  39.57 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2097  biotin synthase  39.8 
 
 		 347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  36.62 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  38.1 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  39.21 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  40.55 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  39.86 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  39.2 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  38.36 
 
 		 351 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  39.12 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  32.54 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  37.79 
 
 		 349 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  37.39 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  36.74 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  38.44 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  38.77 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  37.5 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  38.59 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  39.57 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  37.5 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  37.5 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  37.5 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  38.69 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  37.5 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  37.5 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  35.37 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  37.5 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  38.17 
 
 		 344 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  37.5 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  40.74 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  36.49 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  38.33 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  37.5 
 
 		 346 aa  193  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  37.13 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  37.46 
 
 		 352 aa  192  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  36.67 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  39.06 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  36.15 
 
 		 346 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  36.15 
 
 		 346 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  36.15 
 
 		 346 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  36.15 
 
 		 346 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  37.69 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  38.25 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  37.68 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  38.59 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  37.11 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  38.59 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>