More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1274 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
297 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6963  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  47.72 
 
 
282 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3694  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  48.94 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110664 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0155  alpha/beta fold family hydrolase  37.28 
 
 
269 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0153  hydrolase  36.93 
 
 
278 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0161  hypothetical protein  37.28 
 
 
269 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5099  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 
277 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0160  hypothetical protein  37.28 
 
 
269 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0182  hypothetical protein  37.28 
 
 
269 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0204  hypothetical protein  37.28 
 
 
269 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4947  putative hydrolase  39.86 
 
 
283 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1562  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 
281 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424412  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6037  hypothetical protein  36.5 
 
 
273 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2980  alpha/beta hydrolase fold protein  38.23 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3267  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0078  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4785  alpha/beta hydrolase fold protein  33.78 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  34.9 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.439503  hitchhiker  0.00517721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1268  hypothetical protein  34.75 
 
 
290 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0354701  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  35.57 
 
 
287 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 
280 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0121  hypothetical protein  29.59 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  30.67 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  35.54 
 
 
233 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  34.71 
 
 
233 aa  62.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
324 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  36 
 
 
494 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  30.36 
 
 
286 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  27.43 
 
 
219 aa  59.3  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
248 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  32.77 
 
 
456 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.81 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
253 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  36.11 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  34.36 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  38.79 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  32.76 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  32.39 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.38 
 
 
434 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
425 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.62 
 
 
284 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  34.65 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
275 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  29.36 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  28.12 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
278 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.32 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  31.88 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  31.01 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  34.4 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
277 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  28.21 
 
 
264 aa  52.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
350 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  30.83 
 
 
275 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
303 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
323 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
322 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
255 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  42.5 
 
 
271 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>