45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5053 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  538  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  66.41 
 
 
265 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  43.7 
 
 
287 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  46.12 
 
 
257 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  41.9 
 
 
282 aa  195  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  39.92 
 
 
269 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  32.83 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  40.38 
 
 
253 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  48.12 
 
 
166 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  34.12 
 
 
261 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  33.85 
 
 
261 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  31.92 
 
 
261 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  34.77 
 
 
258 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  32.82 
 
 
258 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  34.65 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  30.92 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  30.16 
 
 
229 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  26.14 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  27.78 
 
 
524 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  22.78 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.57 
 
 
334 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  22.49 
 
 
248 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
297 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 
297 aa  45.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  25 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3502  hypothetical protein  26.07 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
423 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4701  putative hydrolase protein  22.29 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0255091  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  21.26 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
421 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  24.22 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  28.7 
 
 
386 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  27.52 
 
 
286 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>