More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3356 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3356  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00613181  normal  0.200159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  71.39 
 
 		 420 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  73.13 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  72.02 
 
 		 423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  69.95 
 
 		 421 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  69.34 
 
 		 421 aa  541  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2332  histidyl-tRNA synthetase  69.92 
 
 		 418 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2285  histidyl-tRNA synthetase  69.92 
 
 		 418 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2324  histidyl-tRNA synthetase  69.92 
 
 		 418 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0514444  normal  0.0262983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 		 441 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  58.39 
 
 		 421 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 418 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 423 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  46.8 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 419 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 419 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  44.28 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 419 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 435 aa  332  5e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 416 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 417 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 413 aa  322  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 422 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 425 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 424 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 424 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 424 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 413 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 422 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 418 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 426 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 424 aa  318  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 424 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  317  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  317  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  317  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  43.73 
 
 		 424 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  317  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  317  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 417 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 431 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  44.94 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 423 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 415 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>