34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3105 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  977    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  31.84 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  32 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  29.8 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  31.23 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1263  myosin  27.73 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  31.79 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  36.26 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  30.43 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  31.87 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  26.27 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  28.61 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  29.12 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2396  putative cellulose-binding protein  29.84 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  30.71 
 
 		 817 aa  64.7  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  34.03 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  30.17 
 
 		 809 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  28.28 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26990  hypothetical protein  35.14 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal  0.928887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  34.96 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1250  putative cellulose-binding protein  32.39 
 
 		 317 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  30 
 
 		 325 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3956  hypothetical protein  34.34 
 
 		 272 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1040  putative cellulose-binding protein  29.52 
 
 		 235 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554825  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11699  hypothetical protein  28.29 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  34.43 
 
 		 277 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  28.34 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  29.57 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  27.78 
 
 		 757 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  34.23 
 
 		 263 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  35.64 
 
 		 238 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  33 
 
 		 245 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3691  hypothetical protein  29.52 
 
 		 238 aa  43.5  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  30.12 
 
 		 245 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>