34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2135 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  100 
 
 
547 aa  1066    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  33.76 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  33.88 
 
 
554 aa  83.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  34.48 
 
 
615 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  34.48 
 
 
615 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  34.48 
 
 
615 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  34.58 
 
 
545 aa  80.1  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  31.72 
 
 
619 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  33.33 
 
 
627 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  34.76 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  30.77 
 
 
554 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  30.6 
 
 
656 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  31.45 
 
 
609 aa  70.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  27.84 
 
 
507 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  30.15 
 
 
654 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  33.33 
 
 
569 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  29.48 
 
 
590 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  31.37 
 
 
562 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  26.79 
 
 
594 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  31 
 
 
516 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  27.08 
 
 
533 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  32.04 
 
 
561 aa  55.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  27.08 
 
 
469 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  24.56 
 
 
368 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  35.12 
 
 
339 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  26.59 
 
 
501 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  27.85 
 
 
280 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  29.69 
 
 
355 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  30.88 
 
 
246 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  27.62 
 
 
563 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  29.03 
 
 
525 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  29.55 
 
 
507 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  28.16 
 
 
320 aa  44.3  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  29.41 
 
 
557 aa  43.9  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>