22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0699 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  100 
 
 		 275 aa  544  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  29.72 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  30.68 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  32.2 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  26.29 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  24.83 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  26.87 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  28.41 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  30.62 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  29.07 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  28.06 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  28.8 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  31.16 
 
 		 539 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  31.1 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  29.44 
 
 		 544 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  25.18 
 
 		 480 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  26.87 
 
 		 326 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  29.26 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  20.61 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  26.97 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  28.4 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  24.08 
 
 		 385 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>