36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0542 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  29.65 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  28.65 
 
 		 196 aa  90.1  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  34.88 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  35.71 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  36.36 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  37.5 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  36.47 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  35.16 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  34.48 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  37.5 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  36.14 
 
 		 137 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  32.26 
 
 		 149 aa  53.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  28.29 
 
 		 162 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  26.63 
 
 		 169 aa  51.6  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  33.33 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  33.04 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  31.65 
 
 		 157 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  31.4 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  31.43 
 
 		 150 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  31.43 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.44 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 162 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  30.38 
 
 		 278 aa  45.4  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  31.4 
 
 		 166 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5636  RDD domain-containing protein  25.16 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  32.56 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 634 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  31.4 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  26.19 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  31.25 
 
 		 141 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  31.65 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  27.04 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>