More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0253 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0253  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
313 aa  634    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  41.95 
 
 
315 aa  204  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0505  thiamine-monophosphate kinase  38.22 
 
 
314 aa  192  5e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0139572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  38.13 
 
 
324 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  37.83 
 
 
312 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  39.22 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1820  thiamine-monophosphate kinase  39.92 
 
 
327 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  36.75 
 
 
323 aa  169  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  36 
 
 
323 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3043  thiamine-monophosphate kinase  39.7 
 
 
357 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426157  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  36.49 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  35.89 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  38.61 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  35.29 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4643  thiamin-monophosphate kinase  34.87 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567008  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2024  thiamine-monophosphate kinase  36.61 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.908086  normal  0.0114447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  34.26 
 
 
338 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  36.58 
 
 
339 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  36.71 
 
 
338 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  36.99 
 
 
332 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  38.82 
 
 
323 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2665  thiamine-monophosphate kinase  36.75 
 
 
338 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.59 
 
 
323 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  35.69 
 
 
317 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  35.79 
 
 
322 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1530  thiamine-monophosphate kinase  40.52 
 
 
320 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.160353  normal  0.929464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  38.2 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0208  thiamine-monophosphate kinase  34.47 
 
 
331 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  40.25 
 
 
318 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  37.92 
 
 
319 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.25 
 
 
318 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  40.34 
 
 
323 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  40.25 
 
 
323 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  40.25 
 
 
323 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  40.25 
 
 
323 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  40.25 
 
 
323 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  39.33 
 
 
319 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  40.43 
 
 
318 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  36.75 
 
 
325 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  40.25 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  35.1 
 
 
323 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  37.89 
 
 
318 aa  153  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0695  thiamine monophosphate kinase  38.73 
 
 
321 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  38.67 
 
 
329 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  38.67 
 
 
329 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  35.52 
 
 
336 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  36.04 
 
 
321 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  40 
 
 
323 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  38.28 
 
 
329 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.14 
 
 
318 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  40.08 
 
 
327 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  37.16 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  37.64 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  36.82 
 
 
322 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  36.21 
 
 
325 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  38.4 
 
 
326 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  37.09 
 
 
330 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  36.09 
 
 
325 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  39.48 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  35.74 
 
 
325 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  36.15 
 
 
322 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  37.94 
 
 
319 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  39.32 
 
 
332 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  39.48 
 
 
332 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  39.48 
 
 
332 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  37.55 
 
 
326 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2755  thiamine monophosphate kinase  39.48 
 
 
332 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281901  normal  0.6872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  36.58 
 
 
315 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  30.82 
 
 
320 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  30.82 
 
 
320 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  35.54 
 
 
321 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  33.86 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  36.51 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  33.22 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  37.07 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  33.1 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  36.86 
 
 
332 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  38.89 
 
 
332 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  38.89 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06770  thiamine monophosphate kinase  36.88 
 
 
321 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  35.02 
 
 
320 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2773  thiamine-monophosphate kinase  38.11 
 
 
310 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  32.99 
 
 
321 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  31.94 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  34.14 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
326 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0658  thiamine-monophosphate kinase  33.98 
 
 
323 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0295042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  34.64 
 
 
335 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  33.8 
 
 
321 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  36.55 
 
 
324 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  35.81 
 
 
322 aa  136  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  36.21 
 
 
323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  34.04 
 
 
318 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  38.17 
 
 
323 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  33.79 
 
 
361 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  37.24 
 
 
316 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  35.05 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  32.29 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  36.84 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>