78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6077 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  100 
 
 
119 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  78.23 
 
 
124 aa  182  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  59.32 
 
 
118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  59.32 
 
 
118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  59.32 
 
 
118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  51.28 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  43.44 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  40.34 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  48.35 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  45.61 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  39.32 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  39.47 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  42.2 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  33.04 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  32.17 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  32.17 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  32.17 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  32.17 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  32.17 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  32.17 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  32.17 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  32.17 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  42.99 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  35.38 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  38.39 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  32.17 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  41.76 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  30.28 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  37.41 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  46.58 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  42.35 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  45.68 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  43.33 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  29.91 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  43.14 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  42.53 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  33.96 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  38.82 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  38.05 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  42.25 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  42.25 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  46.25 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  34.12 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  39.33 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  35.85 
 
 
240 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  27.78 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  31.11 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  40 
 
 
180 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  34.92 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  28.57 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  42.24 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  27.03 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  36.21 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  39.73 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  26.61 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35.71 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  25.69 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  26.61 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  36.11 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  41.43 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  41.18 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  41.79 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  32.58 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  30.85 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  39.73 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  50 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 
132 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  34.72 
 
 
116 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>