More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4910 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4910  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
390 aa  814    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0074  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.51 
 
 
396 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4273  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.31 
 
 
356 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0190  Rieske (2Fe-2S) protein  35.36 
 
 
365 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3483  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.54 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.74 
 
 
392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1773  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.92 
 
 
383 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0119557  normal  0.0397341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6845  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.07 
 
 
398 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6236  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.35 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6562  normal  0.612429 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1196  Rieske (2Fe-2S) protein  30.29 
 
 
401 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5229  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.62 
 
 
390 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395256  normal  0.666696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  28.2 
 
 
384 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.2 
 
 
362 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.47 
 
 
362 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  34.17 
 
 
427 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3814  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
430 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.387965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 
418 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
384 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.17 
 
 
427 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
427 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164916  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  32.74 
 
 
444 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  31.22 
 
 
414 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4188  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
429 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0795618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3895  ring hydroxylating dioxygenase, Rieske (2Fe-2S) protein  30.25 
 
 
423 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5079  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.66 
 
 
448 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  31.68 
 
 
380 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2496  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit/Rieske (2Fe-2S) protein  32.16 
 
 
427 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0124288  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  24.45 
 
 
393 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  34.1 
 
 
483 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0685  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  34.1 
 
 
484 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1826  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.56 
 
 
429 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.942727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.42 
 
 
383 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.66 
 
 
427 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0996141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0662  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.77 
 
 
455 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.66 
 
 
427 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0488  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.77 
 
 
455 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0463  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.07 
 
 
484 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.328369  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.64 
 
 
483 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1622  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.64 
 
 
484 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0299575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1647  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.64 
 
 
484 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0567  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.03 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2237  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.03 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5626  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.03 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.52 
 
 
432 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.09 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369719  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.81 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1716  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.98 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77849  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1660  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.98 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  27.11 
 
 
380 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0537  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.98 
 
 
466 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1689  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.98 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0546  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.98 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.61 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1680  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.27 
 
 
355 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  hitchhiker  0.000101719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4220  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.82 
 
 
467 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1617  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.35 
 
 
455 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541424  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1642  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.35 
 
 
455 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1668  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.35 
 
 
455 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779225  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.92 
 
 
423 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252321  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  23.24 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4213  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.96 
 
 
444 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.68 
 
 
423 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3851  Rieske (2Fe-2S) protein  29.41 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3747  Rieske (2Fe-2S) region  30.5 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00627634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3820  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.5 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365881  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.65 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  38.98 
 
 
487 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3683  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
419 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804885  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.05 
 
 
406 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.84 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.23 
 
 
373 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  30.65 
 
 
427 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  27.84 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2691  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  34.15 
 
 
453 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.244955  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02430  3-phenylpropionate dioxygenase, large (alpha) subunit  34.15 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1130  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  34.15 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2690  3-phenylpropionate dioxygenase alpha subunit  34.15 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3192  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.94 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1139  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, alpha subunit-like protein  34.15 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0973  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.14 
 
 
396 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0971663  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02394  hypothetical protein  34.15 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1560  Rieske (2Fe-2S) region  27.31 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4346  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.42 
 
 
505 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4415  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.43 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  31.25 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0146  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.72 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32160  anthranilate dioxygenase large subunit  29.46 
 
 
464 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3759  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
440 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0223979  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2725  anthranilate 1,2-dioxygenase, large subunit  29.46 
 
 
464 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08656  Rieske 2Fe-2S family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06450)  28.43 
 
 
431 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.36 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3376  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.41 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151153  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2464  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
425 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31454  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3161  benzoate dioxygenase, alpha subunit  28.95 
 
 
452 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.35 
 
 
463 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.548645  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1007  putative Rieske-type ring dioxygenase  24.12 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152396  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1666  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.35 
 
 
463 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.95 
 
 
452 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.35 
 
 
463 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726822  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1690  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.35 
 
 
463 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>