More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2019 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1794  propionyl-CoA carboxylase  78.92 
 
 
498 aa  762    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4327  propionyl-CoA carboxylase  91.77 
 
 
498 aa  911    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1841  propionyl-CoA carboxylase  78.92 
 
 
498 aa  762    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.151151  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2019  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
498 aa  1003    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1775  propionyl-CoA carboxylase  78.92 
 
 
498 aa  762    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  37.37 
 
 
525 aa  297  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  40.67 
 
 
514 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  39.68 
 
 
538 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  36.88 
 
 
517 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  36.58 
 
 
514 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  38.2 
 
 
514 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  35.99 
 
 
516 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  36.36 
 
 
514 aa  280  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  36.58 
 
 
514 aa  280  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  38.25 
 
 
529 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  33.4 
 
 
514 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  35.74 
 
 
516 aa  276  8e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  35.9 
 
 
508 aa  276  8e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  35.53 
 
 
531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  35.33 
 
 
516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  35.33 
 
 
516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  35.74 
 
 
516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  36.49 
 
 
517 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  34.88 
 
 
516 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  34.2 
 
 
510 aa  272  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  32.86 
 
 
515 aa  271  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  33.6 
 
 
514 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  37.2 
 
 
513 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  34 
 
 
518 aa  270  4e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2593  propionyl-CoA carboxylase  35.12 
 
 
505 aa  269  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  36.13 
 
 
532 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  35.52 
 
 
522 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  36.88 
 
 
520 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1198  carboxyl transferase domain protein  36.95 
 
 
548 aa  268  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462076 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  35.06 
 
 
512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  34.18 
 
 
517 aa  267  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  35.8 
 
 
516 aa  267  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  36.22 
 
 
531 aa  266  7e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  36.58 
 
 
515 aa  266  8e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  36.73 
 
 
521 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  37.3 
 
 
515 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  34.71 
 
 
516 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  33.65 
 
 
514 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  37.37 
 
 
508 aa  264  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  34.33 
 
 
516 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  34.72 
 
 
517 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  33.91 
 
 
514 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  36.09 
 
 
513 aa  262  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  35.4 
 
 
513 aa  262  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  37.57 
 
 
519 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  34.55 
 
 
510 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  34.55 
 
 
510 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  33.93 
 
 
518 aa  261  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  36.27 
 
 
516 aa  260  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  37.82 
 
 
519 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  36.19 
 
 
523 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  36.11 
 
 
510 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  34.34 
 
 
510 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1632  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase component  36.34 
 
 
540 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  34.65 
 
 
528 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  35.52 
 
 
516 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  34.48 
 
 
519 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  35.63 
 
 
517 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  35.1 
 
 
518 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  37.82 
 
 
519 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  34.62 
 
 
527 aa  257  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  36.21 
 
 
531 aa  256  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  34.87 
 
 
510 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  34.83 
 
 
534 aa  256  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  33.06 
 
 
513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1342  carboxyl transferase  34.58 
 
 
511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525317  normal  0.223983 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1854  propionyl-CoA carboxylase  34.26 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  34.67 
 
 
510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  34.06 
 
 
518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  34.97 
 
 
520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  36.29 
 
 
537 aa  254  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  33.2 
 
 
521 aa  254  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  34.52 
 
 
517 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  34.55 
 
 
510 aa  254  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  33.94 
 
 
510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  35.16 
 
 
510 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  34.93 
 
 
512 aa  253  5.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  36.91 
 
 
524 aa  253  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  37.03 
 
 
520 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  33.47 
 
 
518 aa  253  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  34.53 
 
 
510 aa  253  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  33.67 
 
 
513 aa  253  7e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  35.2 
 
 
510 aa  253  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  34.06 
 
 
524 aa  253  8.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  32.26 
 
 
508 aa  252  1e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2974  carboxyl transferase  33.01 
 
 
515 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1979  propionyl-CoA carboxylase  35 
 
 
518 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660708  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  36.11 
 
 
510 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  33.87 
 
 
520 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  37.68 
 
 
510 aa  252  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  35.63 
 
 
542 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  33.47 
 
 
513 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  33.33 
 
 
564 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3891  propionyl-CoA carboxylase  34.07 
 
 
533 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2771  carboxyl transferase  34.01 
 
 
510 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>