More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1574 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0773  amino acid permease-associated region  66.87 
 
 		 516 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155381  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4853  amino acid permease-associated region  94.33 
 
 		 476 aa  902    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1574  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 503 aa  994    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0951  amino acid permease-associated region  66.67 
 
 		 494 aa  605  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  47.78 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1744  amino acid permease-associated region  45.98 
 
 		 510 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.579439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  47.57 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  42.16 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  44.05 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  42.97 
 
 		 507 aa  359  7e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5297  amino acid ABC transporter permease  41.57 
 
 		 535 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.00229664  normal  0.376722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5345  amino acid permease-associated region  41.37 
 
 		 513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0813  amino acid permease-associated region  42.34 
 
 		 516 aa  356  6.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5206  amino acid permease-associated region  41.16 
 
 		 535 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959368  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0176  amino acid permease-associated region  40.76 
 
 		 512 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0710  amino acid permease-associated region  39.5 
 
 		 513 aa  339  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0877  amino acid permease-associated region  41.41 
 
 		 517 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0758  amino acid permease-associated region  43.27 
 
 		 524 aa  324  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0840  amino acid permease-associated region  40.12 
 
 		 511 aa  312  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4678  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 508 aa  292  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4908  amino acid permease-associated region  38.39 
 
 		 484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4004  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3425  amino acid permease-associated region  27.16 
 
 		 456 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3079  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 456 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1629  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 485 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02383  amino acid transporter transmembrane protein  28.91 
 
 		 458 aa  140  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0575  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  26.48 
 
 		 461 aa  100  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 461 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  26.26 
 
 		 461 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  26.26 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  26.26 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  26.26 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  26.26 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  26.26 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 453 aa  94  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  24.76 
 
 		 456 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  27.83 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 456 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  24.63 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 459 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 443 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 443 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 443 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 443 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  24.61 
 
 		 449 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 443 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 450 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  24.35 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25.12 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.37 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.3 
 
 		 460 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  23.08 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  25.68 
 
 		 443 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  26.06 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.87 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  26.89 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  26.89 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  26.89 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  25.9 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  22.87 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25.34 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.53 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.53 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.53 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.53 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.53 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.53 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  24.33 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 549 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.72 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.72 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.24 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.06 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  24.33 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 447 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.72 
 
 		 471 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 440 aa  76.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  21.16 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.72 
 
 		 471 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.24 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>