64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1172 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  94.57 
 
 
1126 aa  2182    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  94.17 
 
 
1118 aa  2145    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  54.94 
 
 
1121 aa  1194    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  100 
 
 
1120 aa  2290    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  94.1 
 
 
1120 aa  2150    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  94.1 
 
 
1120 aa  2150    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  32.9 
 
 
1120 aa  432  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  28.42 
 
 
1126 aa  328  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  28.26 
 
 
1124 aa  307  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  27.76 
 
 
1137 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  27.06 
 
 
1143 aa  287  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  28.04 
 
 
1128 aa  284  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  27.49 
 
 
1118 aa  269  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  25.61 
 
 
1140 aa  254  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  25.04 
 
 
1136 aa  252  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  25.4 
 
 
1153 aa  249  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  25.8 
 
 
1125 aa  240  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  23.67 
 
 
1144 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  25.44 
 
 
1123 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  24.96 
 
 
1154 aa  231  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  25.96 
 
 
1151 aa  226  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  24.8 
 
 
1130 aa  226  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  24.33 
 
 
1125 aa  225  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  24.53 
 
 
1121 aa  222  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.79 
 
 
1143 aa  221  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  25.62 
 
 
1120 aa  221  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  25.16 
 
 
1124 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  23.32 
 
 
1122 aa  214  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  22.96 
 
 
1133 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  24.31 
 
 
1121 aa  209  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  23.65 
 
 
1121 aa  204  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  23.26 
 
 
1121 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  23.41 
 
 
1121 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  25.46 
 
 
1146 aa  200  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  24.55 
 
 
1114 aa  198  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  24.67 
 
 
1125 aa  183  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  27.02 
 
 
1166 aa  171  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  23.9 
 
 
1045 aa  158  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  27.72 
 
 
1133 aa  157  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  23.84 
 
 
979 aa  147  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  23.97 
 
 
694 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  29.95 
 
 
352 aa  89.4  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  24.58 
 
 
406 aa  88.6  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  24.04 
 
 
1181 aa  80.1  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  24.51 
 
 
462 aa  79.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  31.17 
 
 
1159 aa  58.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  22.22 
 
 
1109 aa  58.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  32.26 
 
 
1159 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  32.26 
 
 
1159 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  30.83 
 
 
1145 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  27.31 
 
 
1207 aa  55.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  19.36 
 
 
1113 aa  54.7  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  29.58 
 
 
1138 aa  52.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  30.87 
 
 
1093 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  36.21 
 
 
1146 aa  48.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  45.45 
 
 
1082 aa  47  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  39.53 
 
 
1226 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  25.18 
 
 
1149 aa  45.8  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  39.53 
 
 
1226 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  41.86 
 
 
1190 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  30.23 
 
 
1228 aa  45.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  37.21 
 
 
1208 aa  45.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  26.36 
 
 
1146 aa  44.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  37.21 
 
 
1217 aa  44.7  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>