50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2223 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  100 
 
 
1138 aa  2338    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  33.57 
 
 
1141 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  31.82 
 
 
1140 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  27.4 
 
 
1159 aa  334  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  27.04 
 
 
1159 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  26.81 
 
 
1159 aa  325  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  26.89 
 
 
1145 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  25.06 
 
 
1159 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  23.77 
 
 
1113 aa  216  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  22.66 
 
 
1109 aa  183  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  25.51 
 
 
1107 aa  174  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  22.78 
 
 
1093 aa  169  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  23.25 
 
 
1228 aa  118  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  24.32 
 
 
1207 aa  98.6  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  22.37 
 
 
1122 aa  58.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  25.45 
 
 
1214 aa  57.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  33.04 
 
 
1136 aa  55.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  23.84 
 
 
1114 aa  55.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  23.14 
 
 
1121 aa  55.1  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  30.83 
 
 
1133 aa  54.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  30.28 
 
 
1120 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  30.28 
 
 
1126 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  30.28 
 
 
1120 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  34.04 
 
 
1125 aa  52.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  29.58 
 
 
1120 aa  52.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  22.22 
 
 
1045 aa  52  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  29.58 
 
 
1118 aa  52  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  23.63 
 
 
1125 aa  51.6  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  28.69 
 
 
1121 aa  51.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  23.58 
 
 
1121 aa  50.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  28.69 
 
 
1125 aa  49.7  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  30 
 
 
1124 aa  49.7  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  30.95 
 
 
1121 aa  50.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  29.79 
 
 
1121 aa  48.9  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  35.8 
 
 
1118 aa  48.9  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  31.82 
 
 
1126 aa  48.5  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  21.13 
 
 
1151 aa  48.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  43.75 
 
 
1224 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3975  hypothetical protein  20.15 
 
 
1411 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225862 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  35.48 
 
 
1143 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  25.36 
 
 
1120 aa  48.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  35.48 
 
 
1144 aa  47.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  31.15 
 
 
1140 aa  46.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  29.36 
 
 
1143 aa  46.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  33.67 
 
 
1170 aa  46.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  33.67 
 
 
1170 aa  46.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  27.66 
 
 
1166 aa  46.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  35.29 
 
 
1137 aa  45.8  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  25.98 
 
 
1133 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  26.56 
 
 
1120 aa  45.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>