65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1125 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  100 
 
 		 1133 aa  2340    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  31.36 
 
 		 1140 aa  510  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1121 aa  480  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1125 aa  475  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  30.52 
 
 		 1124 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1143 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  30.64 
 
 		 1122 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1144 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1121 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1121 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1121 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1125 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1133 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1121 aa  432  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1166 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  28.32 
 
 		 1130 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  27.22 
 
 		 1143 aa  309  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1126 aa  303  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1123 aa  291  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1137 aa  268  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  24.91 
 
 		 1124 aa  253  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1120 aa  230  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1121 aa  226  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1120 aa  225  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1120 aa  225  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1126 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  23 
 
 		 1118 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1128 aa  222  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1120 aa  220  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  23.23 
 
 		 1136 aa  203  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  22 
 
 		 1153 aa  190  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  22.83 
 
 		 1154 aa  180  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  42.79 
 
 		 352 aa  177  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1151 aa  174  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1118 aa  162  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1045 aa  162  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  22.56 
 
 		 979 aa  149  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1146 aa  140  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1120 aa  132  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1114 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  25.23 
 
 		 694 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  21.64 
 
 		 1181 aa  110  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  20.58 
 
 		 1125 aa  96.3  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  22.59 
 
 		 1093 aa  75.1  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2246  chromosome segregation ATPase-like protein  25.91 
 
 		 1388 aa  62.4  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  24.37 
 
 		 462 aa  61.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  20.41 
 
 		 1109 aa  55.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  25.93 
 
 		 1107 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0249  Chromosome segregation ATPase-like protein  28.12 
 
 		 1350 aa  53.5  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1214 aa  53.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  33.61 
 
 		 1159 aa  52  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1159 aa  52  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1159 aa  52  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  25.64 
 
 		 1207 aa  51.6  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  27.01 
 
 		 1228 aa  51.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  24.17 
 
 		 406 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  32 
 
 		 1145 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  23.41 
 
 		 1113 aa  50.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  25.96 
 
 		 1159 aa  47.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.32 
 
 		 215 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3475  SMC domain protein  34.78 
 
 		 944 aa  45.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.508672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1140 aa  45.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4117  SMC domain-containing protein  34.78 
 
 		 944 aa  45.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1138 aa  45.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1141 aa  45.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>