52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4003 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  46.42 
 
 
1124 aa  892    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  38.76 
 
 
1137 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  100 
 
 
1126 aa  2268    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  71.35 
 
 
1143 aa  1602    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  35.32 
 
 
1128 aa  562  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  33.36 
 
 
1118 aa  501  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  32.14 
 
 
1125 aa  469  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  30.16 
 
 
1122 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  33.07 
 
 
1120 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  32.04 
 
 
1140 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  31.09 
 
 
1124 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  30.61 
 
 
1121 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  29.53 
 
 
1143 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  30.59 
 
 
1121 aa  443  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  28.7 
 
 
1144 aa  442  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  30.31 
 
 
1121 aa  437  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  29.42 
 
 
1121 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  31.35 
 
 
1166 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  29.61 
 
 
1121 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  29.39 
 
 
1125 aa  436  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  30.52 
 
 
1136 aa  432  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  29.72 
 
 
1130 aa  415  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  31.29 
 
 
1133 aa  409  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  30.76 
 
 
1123 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  29.58 
 
 
1154 aa  357  7.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  29.63 
 
 
1153 aa  348  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  29.18 
 
 
1126 aa  334  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  28.31 
 
 
1120 aa  333  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  28.74 
 
 
1120 aa  328  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  28.74 
 
 
1120 aa  328  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  28.42 
 
 
1118 aa  328  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  28.85 
 
 
1146 aa  325  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  27.71 
 
 
1151 aa  303  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  28.01 
 
 
1114 aa  302  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  26.83 
 
 
1133 aa  301  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  29.3 
 
 
1120 aa  280  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  27.98 
 
 
1125 aa  274  8.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  25.93 
 
 
1121 aa  261  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  25.23 
 
 
1045 aa  230  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  24.75 
 
 
979 aa  218  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  26.43 
 
 
694 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  26.51 
 
 
1181 aa  198  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  49.48 
 
 
352 aa  180  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  25.34 
 
 
462 aa  91.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  25.16 
 
 
406 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  20.9 
 
 
1113 aa  71.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  21.9 
 
 
1109 aa  62  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  27.47 
 
 
1207 aa  55.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  29.75 
 
 
1107 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  31.82 
 
 
1138 aa  48.5  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  25 
 
 
1159 aa  47.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  32.73 
 
 
1093 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>