45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2156 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  98.88 
 
 		 1159 aa  2248    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  95 
 
 		 1159 aa  2172    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  67.9 
 
 		 1145 aa  1420    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  100 
 
 		 1159 aa  2269    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1138 aa  325  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1140 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1141 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  21.18 
 
 		 1109 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  22.95 
 
 		 1159 aa  131  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  29.69 
 
 		 1093 aa  98.6  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  23.48 
 
 		 1113 aa  97.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  27.6 
 
 		 1207 aa  84.7  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  20.94 
 
 		 1107 aa  83.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  31.02 
 
 		 1228 aa  77  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1214 aa  66.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  27.73 
 
 		 1124 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1120 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1120 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1118 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1126 aa  57  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1120 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1121 aa  56.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1121 aa  56.6  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1133 aa  56.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1125 aa  55.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1122 aa  54.3  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1121 aa  54.3  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1120 aa  53.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1114 aa  53.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1121 aa  52.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1118 aa  52.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1121 aa  52  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  27.79 
 
 		 1140 aa  52  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1125 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  33.61 
 
 		 1133 aa  51.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1121 aa  51.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1125 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  30.48 
 
 		 1136 aa  49.7  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1146 aa  48.9  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1123 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1120 aa  46.6  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1166 aa  46.6  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1143 aa  46.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1144 aa  46.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1151 aa  45.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>