63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0892 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  60.34 
 
 
1125 aa  1311    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  57.21 
 
 
1144 aa  1282    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  64.9 
 
 
1133 aa  1418    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  56.94 
 
 
1143 aa  1272    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  65.29 
 
 
1124 aa  1414    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  79.87 
 
 
1121 aa  1810    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  75.38 
 
 
1122 aa  1743    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  42.84 
 
 
1123 aa  812    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  100 
 
 
1121 aa  2292    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  87.6 
 
 
1121 aa  2002    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  63.27 
 
 
1140 aa  1387    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  89.95 
 
 
1125 aa  2055    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  72.65 
 
 
1121 aa  1653    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  74.62 
 
 
1121 aa  1680    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  46.15 
 
 
1130 aa  945    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  44.18 
 
 
1166 aa  902    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  30.3 
 
 
1143 aa  452  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  29.97 
 
 
1133 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  30.31 
 
 
1126 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  30.52 
 
 
1124 aa  399  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  29.29 
 
 
1137 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  28.78 
 
 
1128 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  27.82 
 
 
1118 aa  326  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  24.8 
 
 
1136 aa  280  9e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  24.6 
 
 
1120 aa  258  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  52.03 
 
 
352 aa  252  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  24.98 
 
 
1154 aa  245  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  24.76 
 
 
1153 aa  235  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  24.8 
 
 
1120 aa  224  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  24.8 
 
 
1120 aa  224  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  24.82 
 
 
1118 aa  222  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  24.53 
 
 
1120 aa  222  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.2 
 
 
1126 aa  217  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  25.02 
 
 
1121 aa  214  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  26.14 
 
 
1146 aa  188  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  26.47 
 
 
979 aa  187  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  25.81 
 
 
1045 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  23.61 
 
 
1151 aa  174  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  23.86 
 
 
1114 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  23.32 
 
 
1125 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  22.45 
 
 
1120 aa  127  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  24.8 
 
 
694 aa  112  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  28.24 
 
 
462 aa  100  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  20.66 
 
 
1113 aa  92.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0895  hypothetical protein  82.61 
 
 
54 aa  84.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  24.53 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  21.88 
 
 
1140 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  21.85 
 
 
1181 aa  65.5  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  24.34 
 
 
1107 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  25 
 
 
1093 aa  62.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  21.9 
 
 
1159 aa  57.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  25.1 
 
 
1228 aa  55.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  31.25 
 
 
1207 aa  55.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  23.1 
 
 
1214 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  27.42 
 
 
1159 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  27.42 
 
 
1159 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  27.42 
 
 
1159 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  21.43 
 
 
1141 aa  51.6  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  23.5 
 
 
1109 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  29.79 
 
 
1138 aa  48.9  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  34.55 
 
 
604 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  26.47 
 
 
1145 aa  47  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0773  hypothetical protein  55.88 
 
 
109 aa  44.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>