48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  100 
 
 
1128 aa  2260    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  35.02 
 
 
1126 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  34.46 
 
 
1143 aa  558  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  32.97 
 
 
1124 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  33.77 
 
 
1118 aa  472  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  30.42 
 
 
1137 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  30.23 
 
 
1136 aa  422  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  29.78 
 
 
1124 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  29.45 
 
 
1125 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  29.15 
 
 
1122 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  29.13 
 
 
1121 aa  366  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  28.91 
 
 
1121 aa  366  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  30.27 
 
 
1123 aa  362  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  28.62 
 
 
1125 aa  361  5e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  29.26 
 
 
1121 aa  356  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  29.31 
 
 
1121 aa  352  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  29.15 
 
 
1153 aa  351  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  28.83 
 
 
1121 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  29.23 
 
 
1140 aa  343  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  27.79 
 
 
1166 aa  339  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  28.08 
 
 
1130 aa  339  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  29.03 
 
 
1120 aa  334  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  28.56 
 
 
1154 aa  332  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  26.51 
 
 
1144 aa  330  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  26.71 
 
 
1143 aa  325  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  29.88 
 
 
1133 aa  317  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  28.17 
 
 
1126 aa  308  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  27.53 
 
 
1120 aa  301  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  27.53 
 
 
1120 aa  301  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  28.04 
 
 
1120 aa  300  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  28.82 
 
 
1146 aa  297  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  27.35 
 
 
1118 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  27.2 
 
 
1151 aa  293  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  28.12 
 
 
1114 aa  282  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  27.81 
 
 
1120 aa  278  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  28.05 
 
 
1121 aa  259  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  29.09 
 
 
1125 aa  221  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  23.77 
 
 
1133 aa  217  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  24.01 
 
 
1045 aa  212  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  24.38 
 
 
979 aa  195  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  23.22 
 
 
1181 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  25.42 
 
 
694 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  39.61 
 
 
352 aa  144  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  25.9 
 
 
462 aa  115  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  28.78 
 
 
406 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  25.11 
 
 
1093 aa  55.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  22.03 
 
 
1107 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  28.4 
 
 
1228 aa  48.5  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>