60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2187 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  56.98 
 
 		 1125 aa  1254    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  94.47 
 
 		 1144 aa  2223    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  56.27 
 
 		 1133 aa  1199    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  100 
 
 		 1143 aa  2368    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  56.79 
 
 		 1124 aa  1243    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  55.74 
 
 		 1121 aa  1237    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  41.28 
 
 		 1123 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  55.16 
 
 		 1122 aa  1245    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  55.59 
 
 		 1121 aa  1233    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  56.94 
 
 		 1121 aa  1274    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  61.13 
 
 		 1140 aa  1346    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  45.28 
 
 		 1130 aa  931    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  56.21 
 
 		 1125 aa  1246    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  54.96 
 
 		 1121 aa  1212    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  55.51 
 
 		 1121 aa  1221    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  43.66 
 
 		 1166 aa  914    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  30.53 
 
 		 1133 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1126 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  30.26 
 
 		 1143 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  28.68 
 
 		 1124 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1137 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1128 aa  311  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1120 aa  300  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1118 aa  291  4e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  23.98 
 
 		 1136 aa  245  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  56.86 
 
 		 352 aa  239  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1126 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1120 aa  225  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1120 aa  225  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1118 aa  226  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1120 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  23.79 
 
 		 1154 aa  206  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  24.03 
 
 		 1153 aa  206  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1121 aa  200  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1146 aa  187  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1045 aa  177  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  23.82 
 
 		 979 aa  169  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1114 aa  160  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1125 aa  145  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1151 aa  144  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1120 aa  125  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  24.05 
 
 		 694 aa  122  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  22.18 
 
 		 1113 aa  117  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  25.64 
 
 		 462 aa  95.1  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1181 aa  92.4  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  23.85 
 
 		 406 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  26.96 
 
 		 1107 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  23.16 
 
 		 1159 aa  62  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1214 aa  60.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  27.48 
 
 		 1093 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  23.87 
 
 		 1109 aa  57.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0895  hypothetical protein  62.16 
 
 		 54 aa  57.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  26.67 
 
 		 1207 aa  55.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1141 aa  50.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1140 aa  49.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  24 
 
 		 1228 aa  49.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1159 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0773  hypothetical protein  66.67 
 
 		 109 aa  48.5  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187735  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1138 aa  47.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1159 aa  46.2  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>