51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0868 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  37.99 
 
 
1143 aa  706    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  38.76 
 
 
1126 aa  701    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  43.04 
 
 
1124 aa  844    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  100 
 
 
1137 aa  2323    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  30.97 
 
 
1118 aa  454  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  30.54 
 
 
1121 aa  435  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  30.06 
 
 
1128 aa  426  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  30.43 
 
 
1125 aa  422  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  29.81 
 
 
1130 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  29.21 
 
 
1122 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  29.96 
 
 
1136 aa  400  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  30.16 
 
 
1125 aa  399  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  29.95 
 
 
1121 aa  399  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  30.22 
 
 
1124 aa  399  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  29.34 
 
 
1121 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  29.96 
 
 
1140 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  29.29 
 
 
1121 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  29.67 
 
 
1133 aa  389  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  30.48 
 
 
1120 aa  383  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  28.89 
 
 
1144 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  28.71 
 
 
1143 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  27.33 
 
 
1154 aa  350  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  28.46 
 
 
1123 aa  341  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  27.37 
 
 
1153 aa  338  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  27.52 
 
 
1166 aa  335  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  27.76 
 
 
1120 aa  295  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  28.05 
 
 
1126 aa  292  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  30.58 
 
 
1121 aa  291  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  27.84 
 
 
1120 aa  284  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  27.84 
 
 
1120 aa  284  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  27.53 
 
 
1118 aa  280  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  26.16 
 
 
1151 aa  266  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  26.64 
 
 
1121 aa  255  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  26.8 
 
 
1146 aa  252  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  25.81 
 
 
1120 aa  244  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  27.69 
 
 
1114 aa  238  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  23.83 
 
 
1045 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  26.42 
 
 
1125 aa  209  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  22.9 
 
 
979 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  27.04 
 
 
1133 aa  194  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  22.79 
 
 
1181 aa  178  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  26.27 
 
 
694 aa  152  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  139  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  25 
 
 
462 aa  103  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  26.98 
 
 
406 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  30.09 
 
 
1113 aa  60.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  23.6 
 
 
1093 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  31.18 
 
 
1159 aa  48.5  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  25.64 
 
 
1207 aa  47  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  35.29 
 
 
1138 aa  45.8  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  23.93 
 
 
1107 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>