46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0741 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  714    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  70.24 
 
 
1125 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  62.1 
 
 
1140 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  54.33 
 
 
1133 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  52.44 
 
 
1125 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  55.41 
 
 
1122 aa  252  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  52.03 
 
 
1121 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  51.22 
 
 
1121 aa  248  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  59.11 
 
 
1121 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  55.33 
 
 
1121 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  54.91 
 
 
1121 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  48.3 
 
 
1144 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  56.86 
 
 
1143 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  52.44 
 
 
1124 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  46.93 
 
 
1130 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  48.22 
 
 
1166 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  49.48 
 
 
1126 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  48.22 
 
 
1143 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  42.71 
 
 
1133 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  43.57 
 
 
1123 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  43.72 
 
 
1124 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  41.62 
 
 
1118 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  39.61 
 
 
1128 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  33.33 
 
 
1137 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  38.42 
 
 
1136 aa  132  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  33.03 
 
 
1153 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  31.67 
 
 
1154 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  32.65 
 
 
1120 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  29.95 
 
 
1120 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  29.46 
 
 
1120 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  29.46 
 
 
1120 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  31.37 
 
 
1045 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  29.44 
 
 
1126 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  30.24 
 
 
979 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  29.05 
 
 
1118 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  27.59 
 
 
1121 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  30.77 
 
 
1114 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  27.88 
 
 
694 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  26.19 
 
 
1151 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  28.16 
 
 
1181 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  30.54 
 
 
1146 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  27.13 
 
 
1120 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  23.27 
 
 
1125 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  34.09 
 
 
462 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0773  hypothetical protein  63.33 
 
 
109 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  27.27 
 
 
406 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>