44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2117 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  100 
 
 
1159 aa  2273    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  68.16 
 
 
1145 aa  1429    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  95 
 
 
1159 aa  2128    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  95.17 
 
 
1159 aa  2161    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  27.26 
 
 
1140 aa  308  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  27.41 
 
 
1141 aa  299  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  26.58 
 
 
1138 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  21.19 
 
 
1109 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  23.61 
 
 
1113 aa  103  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  30.13 
 
 
1093 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  28.92 
 
 
1207 aa  85.1  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  28.29 
 
 
1159 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  31.51 
 
 
1228 aa  79.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  27.88 
 
 
1107 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  22.83 
 
 
1214 aa  65.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  29.02 
 
 
1124 aa  65.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  31.17 
 
 
1120 aa  58.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  31.17 
 
 
1120 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  31.17 
 
 
1120 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  31.17 
 
 
1118 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  32.26 
 
 
1126 aa  57  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  28.63 
 
 
1133 aa  55.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  34.43 
 
 
1121 aa  55.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  28.05 
 
 
1121 aa  55.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  25.48 
 
 
1122 aa  54.3  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  26.02 
 
 
1125 aa  53.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  28.12 
 
 
1121 aa  53.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  27.42 
 
 
1121 aa  52.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  30.89 
 
 
1114 aa  52  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  33.61 
 
 
1133 aa  52  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  28.45 
 
 
1118 aa  51.6  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  33.61 
 
 
1125 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  27.22 
 
 
1140 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  26.2 
 
 
1121 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  30.48 
 
 
1136 aa  49.7  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  26.77 
 
 
1121 aa  49.7  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  32.97 
 
 
1146 aa  48.9  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  25.87 
 
 
1125 aa  48.5  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  38.03 
 
 
1120 aa  47  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  31.78 
 
 
1166 aa  46.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  27.78 
 
 
1123 aa  46.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  31.97 
 
 
1151 aa  45.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  24.25 
 
 
1130 aa  45.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  24.32 
 
 
1144 aa  45.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>