45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2434 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  100 
 
 
1159 aa  2274    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  95.17 
 
 
1159 aa  2175    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  67.73 
 
 
1145 aa  1422    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  98.88 
 
 
1159 aa  2248    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  26.89 
 
 
1138 aa  325  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  27.26 
 
 
1140 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  27.07 
 
 
1141 aa  303  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  21.01 
 
 
1109 aa  151  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  23.74 
 
 
1113 aa  99.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  29.69 
 
 
1093 aa  98.6  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  28 
 
 
1207 aa  87.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  20.94 
 
 
1107 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  27.6 
 
 
1159 aa  81.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4582  Sigma 54 interacting domain protein  31.02 
 
 
1228 aa  76.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  24.04 
 
 
1214 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  27.73 
 
 
1124 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  32.26 
 
 
1120 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  28.05 
 
 
1121 aa  56.6  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  32.26 
 
 
1120 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  32.26 
 
 
1126 aa  57  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  32.26 
 
 
1118 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  32.26 
 
 
1120 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  32.1 
 
 
1121 aa  56.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  29.05 
 
 
1133 aa  56.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  26.42 
 
 
1125 aa  55.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  25.08 
 
 
1122 aa  54.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  28.63 
 
 
1121 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  26.13 
 
 
1114 aa  53.5  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  33.09 
 
 
1120 aa  53.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  27.42 
 
 
1121 aa  53.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  27.01 
 
 
1118 aa  52.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  27.8 
 
 
1121 aa  52  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  27.79 
 
 
1140 aa  51.6  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  33.61 
 
 
1133 aa  51.6  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  33.61 
 
 
1125 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  27.33 
 
 
1121 aa  50.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  27.1 
 
 
1125 aa  50.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  30.48 
 
 
1136 aa  49.7  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  32.97 
 
 
1146 aa  48.9  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.97 
 
 
1143 aa  48.5  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  31.78 
 
 
1166 aa  47  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  24.05 
 
 
1144 aa  47.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  27.84 
 
 
1123 aa  47.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  38.03 
 
 
1120 aa  47  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  31.4 
 
 
1151 aa  45.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>