99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0680 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0680  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 		 431 aa  882    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1454  L-threonine synthase  53.12 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.199227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3541  L-threonine synthase  48.63 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0314915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2734  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.56 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0111  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50.25 
 
 		 430 aa  349  6e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.726642  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0503  L-threonine synthase  47.04 
 
 		 412 aa  340  4e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2977  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.14 
 
 		 422 aa  332  6e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2116  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.86 
 
 		 424 aa  276  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.77 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  22.2 
 
 		 404 aa  87  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  23.5 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  23.29 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  25.74 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  23.32 
 
 		 403 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  25.92 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  22.49 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  24.64 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  25.5 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  24.63 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  24.45 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  23.47 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  25.07 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  25.07 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  21.72 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  24.93 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  24.79 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  22.04 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  22.77 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  21.88 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  24.66 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  21.92 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  23.37 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  24 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  22.04 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  23.23 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  22.79 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  23.88 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  21.94 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  25.64 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  22.84 
 
 		 359 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  22.66 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  22.73 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  26.34 
 
 		 411 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  22 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  23.16 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2793  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.32 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  22 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  23.55 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  22 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  23.14 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  22.93 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  22.32 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  22.93 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  25 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  22.19 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  24.51 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  22.41 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  26.05 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  22.82 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  24.91 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  27.07 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  22.85 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  24.1 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  24.34 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  22.26 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  25.14 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37018  predicted protein  22.05 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00212861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  21.02 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  24.26 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  24.48 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  21.13 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  23.26 
 
 		 360 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  23.88 
 
 		 352 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.59 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  22.54 
 
 		 348 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  22.25 
 
 		 459 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  24.04 
 
 		 362 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  24.01 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  21.64 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  20.45 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  22.25 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  22.52 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  23.85 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  24.52 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  20.42 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  22.03 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  25.31 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  24.5 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  20.91 
 
 		 352 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1836  threonine synthase  23.2 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1745  L-threonine synthase  20.56 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0188218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  21.19 
 
 		 349 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  22.12 
 
 		 370 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  22.28 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  20.91 
 
 		 352 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  21.23 
 
 		 352 aa  43.1  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  22.4 
 
 		 368 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  23.18 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>