More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2715 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 756 aa  1542    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.8 
 
 		 643 aa  197  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  42.8 
 
 		 423 aa  195  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 		 643 aa  193  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.37 
 
 		 643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.53 
 
 		 643 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  42.17 
 
 		 703 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  37.28 
 
 		 849 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  35.55 
 
 		 1264 aa  159  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 		 1239 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 1067 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0317  glycosyl transferase family protein  35.36 
 
 		 329 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 		 1247 aa  139  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.79 
 
 		 1366 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 1044 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 872 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  35.96 
 
 		 521 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 857 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  36.54 
 
 		 597 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 		 1152 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 		 1152 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2562  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.73 
 
 		 578 aa  91.7  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 		 746 aa  91.7  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 		 370 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  34.24 
 
 		 1632 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  34.03 
 
 		 2342 aa  87.8  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  34.03 
 
 		 2342 aa  87.8  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 665 aa  87.4  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  30.08 
 
 		 1806 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  34.83 
 
 		 235 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 		 535 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0265  hypothetical protein  42.39 
 
 		 144 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  36.42 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 1035 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 		 1059 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 995 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 331 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  30.32 
 
 		 2796 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.09 
 
 		 916 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  48.65 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  40.18 
 
 		 294 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  40.18 
 
 		 294 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  40.18 
 
 		 294 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  34.62 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  36.54 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2150  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 		 305 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 1317 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 		 268 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1171 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  48.75 
 
 		 227 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.91 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  32.17 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 983 aa  71.6  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 		 1322 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  33.6 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  49.33 
 
 		 1476 aa  70.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 1301 aa  70.5  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 		 544 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.32 
 
 		 307 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 325 aa  70.5  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 1313 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  27.78 
 
 		 708 aa  68.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 987 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  27.72 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 750 aa  68.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  32.18 
 
 		 678 aa  68.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  48.61 
 
 		 680 aa  68.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  44.16 
 
 		 592 aa  67.4  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 280 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  32.79 
 
 		 334 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.3 
 
 		 853 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 		 311 aa  66.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 1177 aa  66.6  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 1177 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 277 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 1177 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.81 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.6 
 
 		 853 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 1032 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.1 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2458  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00372639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 333 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  32.33 
 
 		 341 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>