More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2591 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  100 
 
 		 294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  58.13 
 
 		 294 aa  318  9e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  59.25 
 
 		 297 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  57.82 
 
 		 296 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  57.19 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  57.68 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  57.43 
 
 		 296 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  56.8 
 
 		 296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  53.87 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  59.04 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  53.85 
 
 		 293 aa  291  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  53.85 
 
 		 293 aa  291  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  55.14 
 
 		 303 aa  288  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  53.08 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  53.5 
 
 		 293 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  57.52 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  54.74 
 
 		 292 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  53.29 
 
 		 293 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  54.55 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  54.23 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  48.49 
 
 		 303 aa  279  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  52.74 
 
 		 306 aa  277  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  48.97 
 
 		 299 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  55.89 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  56.23 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  56.27 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  51.53 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  49.65 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  50 
 
 		 301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  50 
 
 		 296 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  47.16 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  49.49 
 
 		 296 aa  244  9e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  47.24 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  49.42 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  49.17 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  42.29 
 
 		 283 aa  239  5.999999999999999e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  45 
 
 		 292 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  44.7 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  44.48 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  39.86 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  47.99 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  43.66 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  38.89 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  45.8 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  42.61 
 
 		 279 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  43.62 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  44.17 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  43.46 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  42.3 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  44.44 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  42.05 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  45.15 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  44.11 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  41.24 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  40.99 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  44.56 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  41.55 
 
 		 305 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  44.56 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  43.24 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  43.11 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  43.66 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  41.53 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  42.81 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  41.5 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  42.52 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  43.55 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  42.91 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  42.09 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.08 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  42.32 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  42.91 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  42.47 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  41.69 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  37.76 
 
 		 289 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  47.56 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  43.01 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  41.22 
 
 		 272 aa  191  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  40.75 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  40.43 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  40.75 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  41.39 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  40.75 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  41.1 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  41.2 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  40.75 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.48 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  40.48 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  43.41 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  38.78 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  36.75 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  42.07 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  41.01 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  41.49 
 
 		 289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  43.51 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.56 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  42.37 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  40.31 
 
 		 529 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  43.69 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  40 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.79 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>