More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1616 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  855    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  79 
 
 		 421 aa  683    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  71.6 
 
 		 423 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  71.36 
 
 		 424 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  70.64 
 
 		 423 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  68.86 
 
 		 417 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  70.41 
 
 		 423 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  69.9 
 
 		 418 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  69.49 
 
 		 418 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  69.73 
 
 		 418 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  70.41 
 
 		 426 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  69.17 
 
 		 418 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  70.88 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  66.02 
 
 		 418 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  67.64 
 
 		 417 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  63.26 
 
 		 418 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  65.86 
 
 		 416 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  62.53 
 
 		 418 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  64.41 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 418 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 		 416 aa  547  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 417 aa  544  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  65.21 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  62.23 
 
 		 418 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 413 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 416 aa  474  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 		 415 aa  475  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 418 aa  461  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  53.75 
 
 		 488 aa  448  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 409 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0345  tyrosyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 391 aa  385  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.388685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 433 aa  359  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 410 aa  344  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  40.94 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 416 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 421 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 432 aa  293  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1120  tyrosyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 422 aa  292  6e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 447 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1171  tyrosyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 420 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 419 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1100  tyrosyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1044  tyrosyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  38.19 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0550  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 425 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 430 aa  280  4e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 425 aa  279  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 422 aa  278  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0169974  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1536  tyrosyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280779  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11705  tyrosyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.316613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1336  tyrosyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.556286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>