More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2113 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  79.38 
 
 		 417 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  79.38 
 
 		 417 aa  680    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 418 aa  861    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  90.43 
 
 		 418 aa  789    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  79.14 
 
 		 417 aa  698    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  73.56 
 
 		 417 aa  652    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  82.41 
 
 		 417 aa  704    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  72.05 
 
 		 417 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  85.34 
 
 		 418 aa  733    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  65.71 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  64.83 
 
 		 418 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  63.16 
 
 		 418 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 		 418 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 418 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  63.4 
 
 		 418 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  64.51 
 
 		 417 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  63.26 
 
 		 419 aa  555  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 423 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  63.2 
 
 		 421 aa  548  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  64.34 
 
 		 416 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 423 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  61.5 
 
 		 423 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  61.65 
 
 		 416 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  61.5 
 
 		 423 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  61.74 
 
 		 424 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 		 418 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  62.23 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 420 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 		 426 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 419 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 416 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  59.85 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  59.37 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  59.81 
 
 		 416 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 415 aa  475  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  50.61 
 
 		 488 aa  431  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 412 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0345  tyrosyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.388685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 406 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 424 aa  338  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 425 aa  333  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 432 aa  329  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 424 aa  326  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  40.1 
 
 		 424 aa  326  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000651  tyrosyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 418 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 424 aa  318  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 424 aa  318  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 424 aa  315  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 419 aa  313  4.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 418 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 424 aa  312  6.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 418 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 418 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 418 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>