More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4474 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
416 aa  852    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  68.12 
 
 
418 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  67.55 
 
 
417 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  69.43 
 
 
423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  66.59 
 
 
418 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  67.3 
 
 
423 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 
418 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 
418 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  67.3 
 
 
423 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  67.77 
 
 
423 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  65.13 
 
 
418 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  67.8 
 
 
416 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  66.83 
 
 
417 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  65.86 
 
 
419 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  63.61 
 
 
418 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  67.23 
 
 
424 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  61.65 
 
 
418 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  62.23 
 
 
417 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  67.71 
 
 
426 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  65.13 
 
 
417 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  61.89 
 
 
418 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 
421 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  63.2 
 
 
417 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  63.2 
 
 
417 aa  528  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 
419 aa  529  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 
417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 
417 aa  500  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
418 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 
417 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
416 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 
416 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 
415 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
420 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 
414 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 
413 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  60.68 
 
 
422 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 
416 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 
417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  56.07 
 
 
488 aa  462  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
417 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 
418 aa  456  1e-127  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 
409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
416 aa  441  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
412 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 
412 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0345  tyrosyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
391 aa  405  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.388685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 
410 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
406 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
408 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
406 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
406 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
435 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
406 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
433 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
408 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
405 aa  332  6e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
424 aa  328  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  46.45 
 
 
422 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
424 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  40.62 
 
 
424 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
424 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
424 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
424 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
424 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
424 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
421 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1336  tyrosyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
419 aa  316  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.556286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
425 aa  316  6e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
432 aa  315  8e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1044  tyrosyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
420 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  41 
 
 
424 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
431 aa  310  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
420 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
424 aa  309  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
416 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1171  tyrosyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
420 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
424 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
424 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11705  tyrosyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.316613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1100  tyrosyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
425 aa  302  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>