More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27323 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  100 
 
 		 488 aa  999    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 418 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 419 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 417 aa  440  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 415 aa  438  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 420 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 423 aa  425  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 409 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 417 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 423 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 412 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 416 aa  405  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 426 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0345  tyrosyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.388685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 406 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 406 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 408 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 406 aa  342  9e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 410 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 435 aa  335  9e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  43.13 
 
 		 422 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 421 aa  319  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 424 aa  317  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 405 aa  310  5e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 425 aa  307  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  306  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  42.33 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 424 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 424 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 424 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 424 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 424 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 416 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 418 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 425 aa  296  8e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 426 aa  295  9e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119608  Tyrosyl-tRNA synthetase, probable  38.84 
 
 		 484 aa  295  9e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 424 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 432 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0017  tyrosyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 434 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 424 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 447 aa  292  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 420 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>