More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1473 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  82.41 
 
 		 418 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  77.88 
 
 		 417 aa  662    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 417 aa  860    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  77.64 
 
 		 417 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  71.81 
 
 		 417 aa  646    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  80.48 
 
 		 418 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  75.48 
 
 		 417 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  80.38 
 
 		 418 aa  687    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  76.68 
 
 		 417 aa  666    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  65.38 
 
 		 417 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  64.18 
 
 		 418 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  63.55 
 
 		 418 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  63.79 
 
 		 418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  64.66 
 
 		 417 aa  567  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  63.31 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 		 418 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 423 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  65.14 
 
 		 416 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  64.41 
 
 		 419 aa  547  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 423 aa  542  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 423 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  64.34 
 
 		 424 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  62.89 
 
 		 421 aa  536  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 416 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 		 418 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 420 aa  501  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 419 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 		 416 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 		 416 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  59.61 
 
 		 414 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  59.37 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 409 aa  471  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  50.36 
 
 		 488 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 412 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 410 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0345  tyrosyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.388685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 433 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 418 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 418 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 418 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 418 aa  324  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 418 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 418 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 418 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 418 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 425 aa  319  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  40.1 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 416 aa  318  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  41.01 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 431 aa  315  6e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 425 aa  316  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0550  tyrosyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 424 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>