More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0723 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
408 aa  841    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  72.46 
 
 
406 aa  626  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 
406 aa  578  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 
408 aa  577  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  64.46 
 
 
406 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  63.68 
 
 
410 aa  558  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
416 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 
435 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
433 aa  428  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
405 aa  414  1e-114  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
417 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
419 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
418 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
418 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
418 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 
417 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
418 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
418 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
417 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
418 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
417 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
424 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
417 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
417 aa  383  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
417 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
418 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
417 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
416 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
417 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
423 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
424 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
416 aa  373  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
423 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 
423 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 
417 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
413 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  44.47 
 
 
488 aa  369  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
417 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
414 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
423 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
416 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
418 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
418 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
416 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
418 aa  362  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
418 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
418 aa  363  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
416 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 
418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
421 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
419 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
418 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
418 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
424 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
426 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
447 aa  354  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
420 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 
416 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
425 aa  351  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
418 aa  351  2e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
420 aa  349  4e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
420 aa  349  4e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
409 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
415 aa  347  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
418 aa  346  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
419 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
420 aa  345  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
432 aa  345  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
418 aa  345  8.999999999999999e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
424 aa  345  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
432 aa  344  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
424 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
424 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
424 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
424 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
424 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
424 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
425 aa  344  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
424 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
421 aa  343  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
420 aa  342  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.948003 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
424 aa  342  7e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  41.39 
 
 
424 aa  342  7e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
426 aa  339  5e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101088 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1564  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
425 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
421 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5211  tyrosyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
419 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5215  tyrosyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
420 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4797  tyrosyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4898  tyrosyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0033  tyrosyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>