More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0619 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
413 aa  836    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  73.17 
 
 
417 aa  593  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 
418 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 
417 aa  501  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 
418 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 
419 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
418 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 
419 aa  488  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  62.14 
 
 
416 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 
417 aa  484  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 
416 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 
418 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
417 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 
418 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 
418 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 
418 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 
418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 
421 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 
417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 
417 aa  467  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
417 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
417 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
418 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 
426 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 
423 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 
417 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 
423 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 
417 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 
416 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
423 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
417 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 
415 aa  456  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  58.55 
 
 
424 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 
414 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 
423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
416 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
416 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
416 aa  435  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 
420 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
422 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 
409 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  51.23 
 
 
488 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
418 aa  411  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 
418 aa  409  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
412 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
408 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 
433 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
406 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
435 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
406 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
406 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
410 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0345  tyrosyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
391 aa  353  2e-96  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.388685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
406 aa  343  4e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
408 aa  343  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
416 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
424 aa  330  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
405 aa  328  9e-89  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
424 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
420 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
421 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
425 aa  312  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
425 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119608  Tyrosyl-tRNA synthetase, probable  40.71 
 
 
484 aa  310  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1071  tyrosyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
448 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000119232  hitchhiker  0.000872394 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
418 aa  308  9e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1120  tyrosyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.523677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
424 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  40.8 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  44.01 
 
 
422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
425 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
427 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
428 aa  300  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
430 aa  299  7e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1979  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
423 aa  299  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
425 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
432 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
418 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>