More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0726 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 417 aa  847    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  73.17 
 
 		 413 aa  595  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 		 418 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  59.85 
 
 		 418 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 421 aa  514  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  60.15 
 
 		 419 aa  511  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 418 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 418 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  62.93 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 		 416 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  60.68 
 
 		 418 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  62.47 
 
 		 423 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  61.07 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  61.15 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  62.62 
 
 		 424 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 426 aa  481  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 		 416 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  55.02 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 412 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0345  tyrosyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.388685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 424 aa  352  7e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 424 aa  348  8e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 424 aa  338  8e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  42.93 
 
 		 424 aa  338  8e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 425 aa  338  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 405 aa  332  6e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 416 aa  331  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 424 aa  326  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 424 aa  325  7e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 424 aa  324  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 424 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 424 aa  319  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  44.28 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 419 aa  317  2e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 419 aa  316  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06520  tyrosyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 418 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1171  tyrosyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000651  tyrosyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 420 aa  310  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1564  tyrosyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 427 aa  308  9e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1071  tyrosyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000119232  hitchhiker  0.000872394 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>