More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3316 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 428 aa  887    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 430 aa  531  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1507  tyrosyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0498725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 431 aa  528  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000172362  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0550  tyrosyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3297  tyrosyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1536  tyrosyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280779  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0587  hypothetical protein  52.79 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 420 aa  395  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 420 aa  395  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1171  tyrosyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 420 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1100  tyrosyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 419 aa  382  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1044  tyrosyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  45.79 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 425 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  43.74 
 
 		 422 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1979  tyrosyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 423 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1905  tyrosyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13251  normal  0.168807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21660  tyrosyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 422 aa  358  9e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0207964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0639  tyrosyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 414 aa  356  5e-97  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.529761  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1120  tyrosyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 422 aa  355  6.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1896  tyrosyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 428 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1336  tyrosyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.556286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1254  tyrosyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.166593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4797  tyrosyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 419 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5211  tyrosyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4777  tyrosyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4936  tyrosyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 419 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5228  tyrosyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 419 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5314  tyrosyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 419 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5179  tyrosyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 419 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.731963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4898  tyrosyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5215  tyrosyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 420 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1564  tyrosyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4446  tyrosyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 416 aa  339  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  0.300449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2362  tyrosyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 422 aa  339  7e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.587755  decreased coverage  0.00168263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0033  tyrosyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 420 aa  338  8e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1511  tyrosyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000132583 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14310  tyrosyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 447 aa  333  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0115503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 406 aa  332  8e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 406 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0081  tyrosyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0921  tyrosyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0622234  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl587  tyrosyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000761752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1512  tyrosyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.675867  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1815  tyrosyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>