More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1792 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  869    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  92.43 
 
 		 424 aa  806    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 418 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 418 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 420 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 418 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 425 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5215  tyrosyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 420 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5211  tyrosyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4936  tyrosyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 419 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4777  tyrosyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4797  tyrosyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5179  tyrosyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 419 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.731963 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5314  tyrosyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 419 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0033  tyrosyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5228  tyrosyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 419 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4898  tyrosyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 424 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 421 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3297  tyrosyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 433 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  47.88 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1171  tyrosyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 433 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000172362  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0550  tyrosyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1100  tyrosyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 420 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  50.36 
 
 		 422 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1536  tyrosyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280779  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1044  tyrosyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 420 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 424 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1254  tyrosyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.166593 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 419 aa  393  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0017  tyrosyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11705  tyrosyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.316613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0587  hypothetical protein  44.76 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2362  tyrosyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 422 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.587755  decreased coverage  0.00168263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1564  tyrosyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0148  tyrosyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000162194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1507  tyrosyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0498725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1979  tyrosyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0921  tyrosyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0622234  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3294  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1120  tyrosyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06520  tyrosyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1088  tyrosyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 434 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.200739 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 418 aa  385  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 419 aa  382  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1815  tyrosyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2044  tyrosyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000651  tyrosyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 419 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1905  tyrosyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13251  normal  0.168807 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119608  Tyrosyl-tRNA synthetase, probable  45.18 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1071  tyrosyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000119232  hitchhiker  0.000872394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>